一、中央集權(quán)
劉秀以?xún)?yōu)待功臣貴戚為名，賜以爵位田宅，高官厚祿，不過(guò)卻摘除了他們的軍政大權(quán)。劉秀鑒于西漢前期三公權(quán)重，權(quán)柄下移，雖設(shè)三公之位，而把一切行政大權(quán)歸之于設(shè)在中朝由皇帝直接指揮的尚書(shū)臺(tái)。(內(nèi)外朝)
尚書(shū)臺(tái)設(shè)尚書(shū)令一人，秩千石，尚書(shū)仆射一人，六曹尚書(shū)各一人，秩皆為六百石，分掌各項(xiàng)政務(wù)。以下設(shè)有丞、郎、令史等官，所有一切政令都由尚書(shū)臺(tái)直接稟陳皇帝，由皇帝裁決。從此，“天下事皆上尚書(shū)，與人主參決，乃下三（公）府”；“雖置三公，事歸臺(tái)閣”，“三公之職，備員而已”。
但是到了東漢后期，有權(quán)勢(shì)的大臣多加“錄尚書(shū)事”的職銜，從而權(quán)柄再度下移，尚書(shū)臺(tái)又蛻變?yōu)闄?quán)臣專(zhuān)政的工具。(前期集權(quán)，后期起到反作用)
二、整頓吏治
劉秀鑒于西漢后期吏治敗壞、官僚奢侈腐化的積弊，即位以后，注意整頓吏治，躬行節(jié)儉，獎(jiǎng)勵(lì)廉潔，選拔賢能以為地方官吏；并對(duì)地方官吏嚴(yán)格要求，賞罰從嚴(yán)。因而經(jīng)過(guò)整頓之后，官場(chǎng)風(fēng)氣為之一變。故有“內(nèi)外匪懈，百姓寬息”之譽(yù)。
劉秀對(duì)吏治的要求以嚴(yán)苛著稱(chēng)，史載當(dāng)時(shí)“天子勤吏治，俗頗苛刻”“光武承王莽之余，頗以嚴(yán)猛為政”。這也導(dǎo)致了一些高官以微罪或無(wú)罪而受?chē)?yán)懲，例如大司徒伏湛因?yàn)闆](méi)有報(bào)告河南尹和司隸校尉在高廟爭(zhēng)執(zhí)而被罷官；大司徒韓歆因?yàn)槎啻沃毖赃M(jìn)諫而被罷官，終至受責(zé)自殺；大司徒戴涉因所舉薦的太倉(cāng)令犯罪而死于獄中；大司空宋弘因在沒(méi)有證據(jù)的情況下彈劾上黨太守而被罷官；大司空朱浮因“賣(mài)弄國(guó)恩”而被罷官，等等。這種過(guò)于嚴(yán)苛的做法，使一些良臣受冤而死或免官，使君臣離心，此做法也受到了后人的一些批評(píng)。
三、精簡(jiǎn)地方
建武六年（30年），劉秀令司隸州牧各實(shí)所部，省減吏員，縣國(guó)不足置長(zhǎng)吏可合并者，上大司徒、大司空二府。于是劉秀下詔：“并省四百余縣，吏職減損，十置其一。”
四、善待功臣
劉秀善待功臣，分封三百六十多位功臣為列侯，給予他們尊崇的地位，只解其兵權(quán)，并未誅殺太多，這已經(jīng)不多了(畢竟秦朝，誅殺的開(kāi)國(guó)功臣主要有白起、蒙恬、蒙武、李斯等。其中白起、蒙恬被賜死時(shí)不知啥罪，李斯被腰斬滅三族;西漢劉邦登基之時(shí)一口氣封7個(gè)異姓諸侯王，但最后全被劉邦干掉了，燕王臧荼、韓王韓信、趙王張敖、楚王韓信、梁王彭越、英布;劉秀有前人經(jīng)驗(yàn)，他并沒(méi)有苛侍功臣，使他們大多善終，不過(guò)劉秀也誅殺了開(kāi)國(guó)功臣主要有劉揚(yáng)、鄧奉、龐萌三位開(kāi)國(guó)大將，都是被劉秀所殺。其中劉揚(yáng)是真定王，劉秀憑他起家。鄧奉是劉秀鐵哥們，救過(guò)劉秀妻子家人，龐萌是平狄將軍，劉秀親自討伐殺掉。畢竟建國(guó)，皇帝就害怕功高蓋主，領(lǐng)兵一方，不滿(mǎn)起兵，故誅殺功臣，以警示眾臣。)并且招攬大批文吏入朝。劉秀于建武六年（30年）讓功臣列侯回到自己的封地。當(dāng)時(shí)劉秀對(duì)三公要求嚴(yán)格，如果功臣們?cè)诔瘬?dān)任官職的話難免犯錯(cuò)，這樣會(huì)失去爵位和土地，劉秀為了保全他們的爵位的土地才讓他們回到封地，遠(yuǎn)離朝廷。
五、軍制改革
劉秀廢除西漢時(shí)的地方兵制，撤銷(xiāo)內(nèi)地各郡的地方兵，裁撤郡都尉之職，也取消了郡內(nèi)每年征兵訓(xùn)練時(shí)的都試，地方防務(wù)改由招募而來(lái)的職業(yè)軍隊(duì)擔(dān)任。
但是，到了東漢后期，州牧刺史逐漸權(quán)重，兼有軍政財(cái)大權(quán)，地方兵力與勢(shì)力又一次逐漸興起。
六、邊防政策
劉秀以“柔道”治國(guó)，致力于穩(wěn)定統(tǒng)治的經(jīng)濟(jì)建設(shè)和政治建設(shè)，實(shí)行加強(qiáng)中央集權(quán)為中心的軍制改革，針對(duì)周邊少數(shù)族的威脅，制定了以保守為主的邊防政策。
劉秀的邊防政策基本上維護(hù)了東漢政權(quán)邊境安全與社會(huì)穩(wěn)定，成為“光武中興“的重要原因，但其保守性，也對(duì)東漢邊防帶來(lái)了消極的影響以及埋下禍根。