回歸真新鎮(zhèn)
小智在集齊八個徽章后就和小霞小剛一起回真新鎮(zhèn)了，距離關(guān)都聯(lián)盟寶可夢大賽還有一段時間，小智打算在家休息幾天，然后對自己的寶可夢們進行特訓。
走了一路，三人終于到達小智家，小智走進家門后就大聲喊道：“媽，我回來了。”小霞和小剛則是很有禮貌地說道：“打擾了?！?p> 不過，出來的并不是花子，而是小智的喵喵：“少主，你回來了啊喵！”小智見是喵喵開口打了聲招呼：“喵喵，你好?。∥覌寢屧诩覇?？”這時，魔墻人偶也出來了，一出現(xiàn)就給小智一個擁抱！小智也跟魔墻人偶打招呼：“你進化成魔墻人偶了?。」材懔?！”
“小智，你回來了啊，赤可是跟我說你還得幾天才回呢！”花子從房間里走出來，見到小智開心地說道。隨后，看向小霞和小剛，小霞和小剛也跟花子打招呼：“打擾了，阿姨?！?p> 赤虹也從樓上下來了，見到小智一行人，向小霞和小剛打著招呼：“嗯，你們好，我是赤虹，小智的爸爸。你們應該就是武能和水伊的后代吧？小剛，你還記得我嗎？”小剛見到赤虹震驚地說道：“您是當年的挑戰(zhàn)者？”隨后經(jīng)過一番解釋，小智和小霞知道了當年的一些事情：赤虹當年是真的牛！開局就拿走了坂木的原始超夢，然后就去參加道館戰(zhàn)，第一站就是武能的深灰道館，直接讓武能產(chǎn)生了心理陰影。后來，武能就離家出走了，深灰道館就落到了小剛的手中。
小智和小霞大吃一驚，小智趕緊問道：“爸，你的初始寶可夢是超夢？”赤虹一聽，趕緊開口道：“我的初始寶可夢是小火龍了，超夢是從你坂木大叔那里順走的?！毙∠紕t是一臉懵逼，坂木她知道，常青道館訓練家，可超夢是什么寶可夢？有這只寶可夢嗎？見小霞疑惑的樣子，赤虹就跟小霞解釋了超夢是哪種寶可夢，一番解釋過后，小霞覺得自己的世界觀都刷新了。
吃過飯，赤虹要去大木博士的研究所，小智打算去看看自己的寶可夢們。于是，就一起前往大木博士的研究所，當然，小智的喵喵，小霞和小剛也一起跟了過來。
一起來到大木博士的研究所后，赤虹按下門鈴道：“大木博士，我是赤虹，我?guī)≈呛瓦鬟鱽砹??！贝竽静┦恳姵嗪鐜≈莵砹耍_口說道：“小赤，喵喵，你們來了。小智，我等你好久了?！?p> 赤虹見青綠不在，疑惑地看向大木博士，大木博士一眼就看出赤虹想問什么，回答道：“青綠帶著小茂去進行特訓了。”見自己的好友不在這里，赤虹也就興趣不佳地回家了。
就這樣，大木博士的研究所內(nèi)只剩下大木博士和小智一行人。這時，小霞開口問大木博士聯(lián)盟大賽的時間：“對了，博士，比賽開始的時間是什么時候??？”大木博士回答道：“時間是兩個月后，地點是在石英高原?！?p> 小智想了想自己收集八個徽章所用的時間，以及兩個月后的比賽，自己在整個關(guān)都地區(qū)待了一年的樣子，平均在每個道館的時間為三周左右，這其中當然是迷路耗費了太多時間。
大木博士這時開口問道：“小智，你來這里是為了什么？”而小智來這里主要是看自己的寶可夢的，所以對大木博士說道：“對了，博士，我想去看看我的寶可夢們?！?p> 大木博士見狀也說道：“哦，它們啊，都在后面的庭院里，一起去看看吧?！彪S后，小智一行人就跟著博士向另一邊走去。
來到庭院后，小智就將自己帶在身上的寶可夢都放出來了：“出來吧！大針蜂，化石翼龍，噴火龍，呆殼獸和哈克龍，還有超夢和越夢?！边@時，迷你龍突然出來，纏繞在小智的身上，十分開心地叫著，越夢這時也親呢和小智打招呼：“小智哥哥，你好??！”大木博士似乎早就知道超夢和越夢的存在，并沒有露出激動的神情。
小智這時想到了自己的寶可夢們有好多需要連接交換進化的，向大木博士問道：“大木博士，你知道連接交換進化嗎？”大木博士聽后，立刻給出了答案：“連接交換進化啊，只要使用連接交換機器就可以了?！毙≈锹牭酱鸢负笥謫柕溃骸澳?，大木博士你這里有連接交換機器嗎？”一聽這話，大木博士就非常自豪地說道：“當然有啊，這里可是大木博士研究所?！笨磥磉@里的設(shè)備還是很先進的。
小智這時又問道：“那，大木博士，你這里有王者之證和龍之鱗片嗎？”大木博士有些疑惑地問道：“有是有了，不過，小智你需要這些干什么??？”因為關(guān)都地區(qū)只有豪力，隆隆石，勇基拉和鬼斯通連接交換進化成怪力，隆隆巖，胡地和耿鬼的例子，所以大木博士認為小智問自己這些是想要讓勇基拉和鬼斯通進化。而小智問的道具僅僅是用來提升寶可夢的威力罷了。
小智答道：“當然是用來進化寶可夢了?！彪S后對喵喵說道：“喵喵，去把勇基拉，鬼斯通，呆呆獸和海刺龍叫過來吧?！边鬟饕娦≈墙凶约?，立刻回答：“好耶，少主！”然后就去將四只寶可夢叫來了，大木博士看著被喵喵叫過來的四只寶可夢，問小智：“就是這四只嗎？”小智答道：“是的，帶我們?nèi)ミB接交換機器那邊吧？”鬼斯通一出現(xiàn)就和喵喵聊起天來：“嘿嘿，小貓咪，叫鬼大爺來這里干嘛？”“老頑童，你以為我想去叫你啊喵！這次是少主有正事，給我老實點啊喵！”……
看著這兩只活寶寶可夢，小霞和小剛感到十分有意思，小智見狀，向大木博士問道：“這兩只一直都這樣嗎？”大木博士點了點頭，小智見狀立刻用精靈球?qū)⒐硭雇ㄊ栈?，同時將勇基拉也收到了精靈球中，來到連接交換機器前，將精靈球放入機器，對大木博士說道：“大木博士，開啟機器吧！”隨后在大木博士的操作下，勇基拉和鬼斯通完成了連接交換。
大木博士把精靈球給了小智，小智立刻將胡地和耿鬼放出來：“出來吧！”兩只寶可夢一從精靈球中出來就發(fā)出白光，光芒散去，胡地和耿鬼正式登場。
耿鬼進化后立刻就去和喵喵炫耀去了，胡地則是默默地來到小智的身邊，感應著超能力。小智給海刺龍戴上龍之鱗片；給呆呆獸戴上王者之證后，用精靈球收回了兩只寶可夢，將兩只精靈球放入連接交換機器中。隨后，又在大木博士的操作下，兩只寶可夢也完成了連接交換進化。
大木博士隨后又將精靈球給小智，小智也將兩只寶可夢放出來：“出來吧！”從精靈球中出來的兩只寶可夢發(fā)出白光，光芒散去，呆呆王和刺龍王登場了。
見到海刺龍的進化形，小霞激動地問道：“啊！小智，這個是？”小智解釋道：“刺龍王，海刺龍的進化形，水系加龍系的寶可夢?！毙∠家宦牐拥卣f道：“好厲害！原來是水，龍雙系的寶可夢！好，我也要努力！讓墨海馬早日進化！”
大木博士也激動地對小智說：“原來還可以戴道具進行連接交換進化??！小智，你可一定要讓我研究啊！”小智回答道：“當然沒問題啦！”大木博士就帶上呆呆王去進行研究了。這時，小智想到了什么，叫住大木博士：“等等，大木博士！”大木博士被叫住了，問道：“小智，你還有什么事？”
小智開口道：“你這里有沒有熔巖增幅器啊？”大木博士像是想到了什么，問道：“是不是鴨嘴火獸需要進化？”小智點頭，大木博士見狀，拿出一個熔巖增幅器給小智：“拿去吧，別客氣?！比缓?，小智接過熔巖增幅器給鴨嘴火獸帶上，鴨嘴火獸身上發(fā)出進化之光，成功地進化成鴨嘴炎獸了。之后，一行人在喵喵和耿鬼的帶領(lǐng)下去見小智收服的其它寶可夢了。
就這樣，小智開心地陪伴自己的寶可夢們度過了一個下午，直到傍晚時分，赤虹帶著他的超夢叫小智回家吃飯，小智一行人才告別了大木博士研究所回家了。
接下來就是赤虹對小智的特訓時間了，不過，赤虹只幫忙訓練超夢和越夢，小智的其它寶可夢還是由他自己訓練。對此，小智也很樂意，畢竟赤虹的超夢可以說是小智超夢和越夢的父親了。而且小智并不打算讓超夢和越夢在石英大會上登場。