趁著恩雅文明處理內(nèi)患的時(shí)候，瑪爾文明已經(jīng)控制了恩雅文明發(fā)現(xiàn)的十二顆有人類星球。瑪爾文明以神的姿態(tài)出現(xiàn)在這些星球上，并且宣揚(yáng)恩雅邪惡論。
處理完內(nèi)患的恩雅文明發(fā)現(xiàn)自己已經(jīng)被瑪爾文明的新勢力殖民星球包圍了，距離恩雅文明母星較近的有人類星球都開始了全民涅槃，而這些星球所使用的神體無一例外，全部帶有惡魔粒子，好在這些星球文明程度較低，人口基數(shù)不大，其中人口最多的也只有不足一億人口。
文明戰(zhàn)爭爆發(fā)，瑪爾文明看中恩雅文明的航天科技實(shí)力，想以人海戰(zhàn)術(shù)壓垮恩雅文明，以竊取恩雅文明的科技成果。但瑪爾文明小看了恩雅文明的戰(zhàn)斗力，恩雅文明從來不主動(dòng)挑起戰(zhàn)爭，但這不代表恩雅文明武力弱，因?yàn)樯耋w戰(zhàn)士數(shù)量上的差距，恩雅文明不得已啟用了塵封已久的大規(guī)模殺傷性武器。包括瑪爾星球在內(nèi)的十三顆星球在戰(zhàn)爭中變成了一片廢墟，瑪爾文明殘部不知所蹤。而恩雅文明也在這一戰(zhàn)中損失慘重。
為防止瑪爾文明死灰復(fù)燃，恩雅文明展開了星網(wǎng)計(jì)劃，恩雅文明生產(chǎn)了大量生命探測衛(wèi)星，用于尋找生命行星，并對其進(jìn)行監(jiān)控，防止瑪爾文明增兵。
于此同時(shí)恩雅文明也開始了休養(yǎng)生息。恩雅議會通過了建立恩雅星圈的議案，自此恩雅文明開始了大規(guī)模的星球移民，而移民的目標(biāo)便是曾經(jīng)由瑪爾文明掌控的十三顆宜居星球。加上恩雅文明母星，共計(jì)十四顆宜居星球組成了新的恩雅人民棲居地。并以恩雅母星為中心，創(chuàng)建了范圍達(dá)到半徑一千光年的恩雅星圈。經(jīng)過近三千年的努力，恩雅星圈初具規(guī)模，大量的星球被改造，區(qū)域內(nèi)所有蟲洞均有艦隊(duì)守衛(wèi)。
在這三千年里，恩雅文明沒有在仙女座星系發(fā)現(xiàn)瑪爾文明的足跡，恩雅文明內(nèi)部甚至開始有人猜測瑪爾文明可能在宇宙中發(fā)生了意外。直到有一天，鋪天蓋地的瑪爾文明戰(zhàn)艦出現(xiàn)在了恩雅星圈的外圍。許多恩雅文明沒有見過的戰(zhàn)艦種類出現(xiàn)在了瑪爾文明的艦隊(duì)中。
戰(zhàn)爭再一次爆發(fā)了，經(jīng)過了三十多年的戰(zhàn)斗，瑪爾文明最終沒能攻破恩雅星圈。瑪爾文明見識到了恩雅星圈的強(qiáng)大防御力，開始改變策略，以占領(lǐng)仙女座星系的其他有生命星球?yàn)橹?。恩雅文明自然也不會任由瑪爾文明發(fā)展，于是恩雅文明開始了反擊。
自從當(dāng)初接觸瑪爾文明造成惡果之后，恩雅文明沒有再干涉過其他星球的文明進(jìn)程，恩雅文明的大部分精力都放在了恩雅星圈的建立上。
瑪爾文明卷土重來，在形勢的逼迫下，恩雅文明不得不開始全面干涉其他星球的文明進(jìn)程。
恩雅文明開始對仙女座星系其他生命星球進(jìn)行援助。宣傳惡魔粒子的危害，傳播惡魔粒子的排斥物質(zhì)，援助神體。
整個(gè)仙女座星系有著超過一萬億顆的恒星，其中百分之六十以上都有衛(wèi)星（恒星的衛(wèi)星就是行星，地球就是太陽的衛(wèi)星），由于行星不發(fā)光，所以即使是恩雅文明也不清楚仙女系星座到底有多少顆行星，又有多少顆行星上擁有生命。在龐大的基數(shù)面前，恩雅文明援助的神體數(shù)量注定無法滿足星系內(nèi)的所有人，矛盾不可避免，再加上瑪爾文明也在提供神體，雖然瑪爾文明的神體有惡魔粒子存在，但在長生不老的誘惑面前，還是有很多人選擇了投靠瑪爾文明。整個(gè)仙女座星系都陷入了戰(zhàn)爭。由于戰(zhàn)爭形勢的復(fù)雜化，神體成為了戰(zhàn)爭的主力，宇宙戰(zhàn)艦反而難以發(fā)揮作用。神體發(fā)展競賽越演越烈。
恩雅文明并沒有科幻片中所謂的曲速引擎，恩雅文明最快的宇宙飛船可以達(dá)到二分之一光速，但宇宙中有著大量蟲洞存在，恩雅文明繪制了龐大的宇宙蟲洞地圖，這些蟲洞并沒有什么規(guī)律，體積有大有小，蟲洞兩端跨越的距離也有遠(yuǎn)有近，就是這些毫無規(guī)律的蟲洞組成了無比復(fù)雜的星系高速公路，但也只限于仙女座星系內(nèi)。
戰(zhàn)爭一直在持續(xù)，可奇怪的是恩雅文明無論如何也找不到瑪爾文明的基地在哪。
由于恩雅文明從來沒有發(fā)現(xiàn)過連通仙女座星系外的蟲洞，所以恩雅文明高層也從來沒有想過敵人的總部可能不在仙女座星系內(nèi)。
直到有一天，有人發(fā)現(xiàn)了仙女座星系和三角星系中間氫橋的成因。
在兩個(gè)星系中間有著一條長達(dá)78.2萬光年的氫橋，為什么這些氫原子會拉成一個(gè)長條存在于兩個(gè)星系間？這個(gè)問題一直困擾著恩雅文明。
氫橋成因的發(fā)現(xiàn)源于一次意外，有艘艦隊(duì)在仙女座星系外圍發(fā)現(xiàn)了一個(gè)蟲洞，位置在氫橋的延長線上，駛?cè)牒蟀l(fā)現(xiàn)自己出現(xiàn)在了氫橋內(nèi)距離仙女系星座十萬光年左右的位置，再往前行進(jìn)，又發(fā)現(xiàn)了一個(gè)蟲洞，經(jīng)過多個(gè)蟲洞，竟然來到了三角星系的邊緣。
這只艦隊(duì)的艦長認(rèn)為瑪爾文明的基地很可能在三角星系內(nèi)，甚至整個(gè)三角星系可能都在瑪爾文明的掌控之中，艦長決定艦隊(duì)立即返航，在返航過程中艦隊(duì)嘗試了進(jìn)入不同蟲洞，結(jié)果發(fā)現(xiàn)只要一直朝著一個(gè)方向前進(jìn)，就能抵達(dá)前方目標(biāo)星系。
氫橋內(nèi)艦隊(duì)經(jīng)過的所有蟲洞幾乎成一條直線，而氫橋內(nèi)的氫原子也是通過這些蟲洞溢散出來的，因?yàn)橄x洞是一條直線，所以形成了一條氫橋。氫橋的形成之謎解開了，但這一排蟲洞是從哪里來的又成了一個(gè)新的謎題。
恩雅文明得知了氫橋內(nèi)的蟲洞鏈后，立即組織了艦隊(duì)遠(yuǎn)征三角星系，兩個(gè)星系之間的戰(zhàn)爭正式拉開序幕。
第一批前往三角星系的艦隊(duì)損失慘重，進(jìn)入三角星系的蟲洞入口有著嚴(yán)密的防守，由于蟲洞體積原因，所以易守難攻。
在恩雅文明艦隊(duì)撤退的過程中，三角星系派出了追兵，經(jīng)過了一番追逐戰(zhàn)。在追逐戰(zhàn)中，恩雅文明被打散了，戰(zhàn)艦分別進(jìn)入了不同的蟲洞，其中有一艘戰(zhàn)艦幾經(jīng)周轉(zhuǎn)，不知怎么就來到了氫橋的中間區(qū)域，在這里有一個(gè)明顯比其他氫橋蟲洞小很多的蟲洞存在，戰(zhàn)艦駛?cè)牒蟀l(fā)現(xiàn)自己離開了氫橋，眼前出現(xiàn)了一片星空，開始戰(zhàn)艦駕駛以為自己回到了仙女座星系，可觀察后發(fā)現(xiàn)不對，正在這時(shí)瑪爾文明的一艘戰(zhàn)艦追了過來，雙方相遇后并沒有交戰(zhàn)，而是不約而同的往來時(shí)的蟲洞駛?cè)?，他們此刻的想法是必須盡快匯報(bào)自己的發(fā)現(xiàn)。
后來大家才知道，氫橋中間這個(gè)蟲洞的另一端就是銀河系！