根據(jù)提供的文獻(xiàn),慶余年葉輕眉留下的秘密是太平別院湖底的禁忌之門。這個禁忌之門被認(rèn)為是一切秘密的最終所在。范閑與葉輕眉的聯(lián)系涉及到范閑的出生和人的生老病死,被視為一種禁忌行為。葉輕眉為箱子設(shè)了只有五筆輸入法才能解開的密碼,箱子里有三層?xùn)|西,包括一把M82A1重型狙擊步槍和葉輕眉留下的兩封信。葉輕眉留下的三封信詳細(xì)展示了她迎接死亡的全過程,分別寫給了五竹、慶帝和范閑。其中第二封信告知了范閑這個世界的真相,即他所處的現(xiàn)代是舊時代終結(jié)后重新構(gòu)建的世界。此外,葉輕眉還在箱子中放置了一把造型奇特的金屬物品。關(guān)于太平別院湖底的秘密,文獻(xiàn)中沒有具體提及。