慶余年的秘密是關(guān)于神廟的。神廟是一個史前人類文明的軍事博物館,收藏了幾乎所有的史前人類武器。神廟的位置是肖恩知道的,他曾經(jīng)見過葉輕眉從神廟里出來。肖恩將這個秘密告訴了范閑,但葉輕眉要求他不能泄露神廟的位置,因為泄露可能會引發(fā)災(zāi)難。根據(jù)小說和電視劇的簡介,范閑和他的伙伴歷經(jīng)艱險找到了神廟,發(fā)現(xiàn)神廟實際上是一個軍事博物館,保存了史前人類的文明和武器。然而,具體神廟內(nèi)部的秘密以及為何肖恩和荷無法接觸到神廟并沒有明確說明。